Перепрошивка біос - заняття ризиковане.
Найбільш грамотним способом зробити цю процедуру - це використати стандартну програму, що йде в комплекті від виробника.
Але на сьогоднішній день всі виробники випускають обновлялки під DOS/Windows і не особливо паряться про тих, хто використовує Linux/MacOS/FreeBSD/*BSD системи
Але самі користувачі попіклувались про себе і створили flashrom, яка теж opensource і підтримує досить велику базу чіпів для прошивки.
Інсталяція flashrom в різних системах відбувається по різному, я розповім про Ubuntu 14.04, яка на момент написання статті - знаходиться в глубокому dev статусі.
Додаємо PPA в систему - стрічки для додавання в /etc/apt/sources.list

deb http://ppa.launchpad.net/flashrom-developers/flashrom-daily/ubuntu saucy main
deb-src http://ppa.launchpad.net/flashrom-developers/flashrom-daily/ubuntu saucy main

Додаєм ключ і сам репозиторій на майбутнє

sudo add-apt-repository ppa:flashrom-developers/flashrom-daily

На момент написання статті версії flashrom для trusty (14.04) ще не було випущено, тому скористаємся пакетом для попередньої 13ї версії.
Далі все просто

sudo apt-get update
sudo apt-get install flashrom

Наступний крок - резервна копія теперішньої версії біос (backup.rom) і оновлення до нової (EP45DS3L.11b)

sudo flashrom --programmer internal -r backup.rom
sudo flashrom --programmer internal -w EP45DS3L.11b --verbose -o write.log

Перед записом варто перевірити, чи розмір резервної копії збігається з розміром тієї, яку будемо прошивати.